Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PDE6DO43924 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PDE6DO43924 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PDE6DO43924 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PDE6DO43924 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PDE6DO43924 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PDE6DO43924 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PDE6DO43924 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PDE6DO43924 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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