Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms