Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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