Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTLL13PA6NNM8 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 TTC32-201ENST00000333610 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 AC246787.1-201ENST00000392301 627 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 AC097487.1-201ENST00000514134 934 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 LINC02207-201ENST00000554530 1256 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTLL13PA6NNM8 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms