Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA8A3KMH1 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms