Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6M4

CSNK1G3, Casein kinase I isoform gamma-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G3Q9Y6M4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CSNK1G3Q9Y6M4 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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