Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DTX4Q9Y2E6 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms