Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms