Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 214.3 ms