Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms