Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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