Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms