Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX27Q96L92 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms