Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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