Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms