Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms