Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ZNF548Q8NEK5 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ZNF548Q8NEK5 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ZNF548Q8NEK5 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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ZNF548Q8NEK5 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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