Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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