Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLIP4Q8N3C7 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLIP4Q8N3C7 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLIP4Q8N3C7 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLIP4Q8N3C7 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLIP4Q8N3C7 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLIP4Q8N3C7 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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CLIP4Q8N3C7 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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CLIP4Q8N3C7 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLIP4Q8N3C7 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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CLIP4Q8N3C7 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLIP4Q8N3C7 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLIP4Q8N3C7 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLIP4Q8N3C7 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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CLIP4Q8N3C7 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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CLIP4Q8N3C7 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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CLIP4Q8N3C7 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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CLIP4Q8N3C7 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CLIP4Q8N3C7 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLIP4Q8N3C7 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLIP4Q8N3C7 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLIP4Q8N3C7 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLIP4Q8N3C7 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLIP4Q8N3C7 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
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