Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms