Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBRM1Q86U86 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBRM1Q86U86 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBRM1Q86U86 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBRM1Q86U86 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBRM1Q86U86 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBRM1Q86U86 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBRM1Q86U86 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBRM1Q86U86 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBRM1Q86U86 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBRM1Q86U86 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBRM1Q86U86 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBRM1Q86U86 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBRM1Q86U86 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBRM1Q86U86 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PBRM1Q86U86 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBRM1Q86U86 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PBRM1Q86U86 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PBRM1Q86U86 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBRM1Q86U86 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBRM1Q86U86 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBRM1Q86U86 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBRM1Q86U86 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBRM1Q86U86 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBRM1Q86U86 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBRM1Q86U86 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBRM1Q86U86 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PBRM1Q86U86 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBRM1Q86U86 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBRM1Q86U86 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PBRM1Q86U86 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PBRM1Q86U86 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PBRM1Q86U86 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBRM1Q86U86 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBRM1Q86U86 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBRM1Q86U86 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBRM1Q86U86 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBRM1Q86U86 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PBRM1Q86U86 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PBRM1Q86U86 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PBRM1Q86U86 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms