Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 231.4 ms