Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTOP1Q7RTM1 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
OTOP1Q7RTM1 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTOP1Q7RTM1 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTOP1Q7RTM1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTOP1Q7RTM1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
OTOP1Q7RTM1 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTOP1Q7RTM1 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTOP1Q7RTM1 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTOP1Q7RTM1 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTOP1Q7RTM1 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
OTOP1Q7RTM1 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
OTOP1Q7RTM1 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
OTOP1Q7RTM1 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
OTOP1Q7RTM1 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTOP1Q7RTM1 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTOP1Q7RTM1 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
OTOP1Q7RTM1 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
OTOP1Q7RTM1 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTOP1Q7RTM1 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTOP1Q7RTM1 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTOP1Q7RTM1 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTOP1Q7RTM1 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTOP1Q7RTM1 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTOP1Q7RTM1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTOP1Q7RTM1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTOP1Q7RTM1 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTOP1Q7RTM1 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
OTOP1Q7RTM1 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTOP1Q7RTM1 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTOP1Q7RTM1 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTOP1Q7RTM1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTOP1Q7RTM1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTOP1Q7RTM1 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTOP1Q7RTM1 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTOP1Q7RTM1 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTOP1Q7RTM1 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTOP1Q7RTM1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms