Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HECW1Q76N89 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms