Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC174Q6PII3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms