Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms