Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms