Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms