Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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