Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP221Q4G0U5 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms