Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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