Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms