Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLFQ16534 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLFQ16534 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLFQ16534 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLFQ16534 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLFQ16534 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLFQ16534 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLFQ16534 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLFQ16534 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLFQ16534 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HLFQ16534 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLFQ16534 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLFQ16534 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLFQ16534 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLFQ16534 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLFQ16534 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLFQ16534 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLFQ16534 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HLFQ16534 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLFQ16534 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLFQ16534 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLFQ16534 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLFQ16534 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HLFQ16534 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLFQ16534 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLFQ16534 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HLFQ16534 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HLFQ16534 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLFQ16534 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLFQ16534 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLFQ16534 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLFQ16534 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLFQ16534 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLFQ16534 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLFQ16534 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLFQ16534 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLFQ16534 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLFQ16534 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLFQ16534 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HLFQ16534 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HLFQ16534 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HLFQ16534 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLFQ16534 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLFQ16534 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLFQ16534 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLFQ16534 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLFQ16534 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLFQ16534 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLFQ16534 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLFQ16534 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLFQ16534 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLFQ16534 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLFQ16534 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLFQ16534 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLFQ16534 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLFQ16534 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLFQ16534 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms