Protein–RNA interactions for Protein: Q16401

PSMD5, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD5Q16401 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms