Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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ZFHX3Q15911 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZFHX3Q15911 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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