Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EFNB3Q15768 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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EFNB3Q15768 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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EFNB3Q15768 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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EFNB3Q15768 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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EFNB3Q15768 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNB3Q15768 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNB3Q15768 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNB3Q15768 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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EFNB3Q15768 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNB3Q15768 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNB3Q15768 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNB3Q15768 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNB3Q15768 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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