Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms