Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms