Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SLC10A1Q14973 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms