Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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COL4A6Q14031 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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COL4A6Q14031 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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COL4A6Q14031 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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COL4A6Q14031 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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COL4A6Q14031 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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COL4A6Q14031 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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COL4A6Q14031 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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COL4A6Q14031 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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