Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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