Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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HTR4Q13639 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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HTR4Q13639 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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HTR4Q13639 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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HTR4Q13639 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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HTR4Q13639 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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HTR4Q13639 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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HTR4Q13639 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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HTR4Q13639 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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HTR4Q13639 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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HTR4Q13639 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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HTR4Q13639 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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