Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms