Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms