Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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