Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms