Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA3Q08378 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms