Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms