Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms