Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms